More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3322 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  54.85 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 225 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  51.04 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  55.96 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  51.18 
 
 		 197 aa  157  8e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  49.45 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  47.51 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  54.78 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  46.37 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  47.03 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  51.91 
 
 		 182 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  48.25 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 160 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 410 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 425 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.52 
 
 		 400 aa  79  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 309 aa  78.2  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 408 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.67 
 
 		 390 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.56 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 428 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 451 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 391 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  25.62 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 394 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  45.57 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>