More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1169 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 201 aa  270  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 206 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 211 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 217 aa  101  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 248 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  36.03 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  36.24 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  27.36 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4347  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.685734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  31 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.03 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.39 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1650  regulatory protein TetR  33.82 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0671734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.39 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.39 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2298  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  28 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  31.03 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.14 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1572  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>