More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1640 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 393 aa  790    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 394 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 394 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  70.81 
 
 		 394 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 412 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 400 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 425 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 470 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 410 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  28.45 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  25.89 
 
 		 390 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 451 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  27.3 
 
 		 428 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  27.29 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 222 aa  67  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 199 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 193 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  57.63 
 
 		 194 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 216 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  38.84 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  29.55 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 193 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  30.65 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  46.15 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 220 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 246 aa  57  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 186 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 212 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3406  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 188 aa  57  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.122321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4559  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  42.11 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 216 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 248 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 179 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 196 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>