More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4179 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 396 aa  791    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.13 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 385 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  37.75 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 424 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 451 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 451 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.67 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 406 aa  126  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 388 aa  126  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 470 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 393 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 220 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 363 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 190 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 193 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 197 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 196 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 214 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 203 aa  58.9  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  27.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 197 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 219 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  30.93 
 
 		 211 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 205 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 202 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 195 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4581  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.133815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.94 
 
 		 200 aa  54.3  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 212 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  26.35 
 
 		 210 aa  53.5  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 204 aa  53.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 221 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 199 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 207 aa  53.1  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 231 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 212 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 197 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 228 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 251 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 260 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  37.14 
 
 		 237 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 194 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 219 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 260 aa  51.2  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  28.87 
 
 		 215 aa  51.2  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 198 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 198 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>