More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20320 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 
214 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 
205 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 
202 aa  153  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  47.42 
 
 
209 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 
211 aa  144  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  47.18 
 
 
217 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.18 
 
 
390 aa  68.9  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.53 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 
224 aa  64.7  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 
211 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
229 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
198 aa  62.4  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
197 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
223 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 
210 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
256 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  32.69 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.88 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
217 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
240 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
208 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  37.62 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1620  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135802  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  30.93 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
206 aa  54.7  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
210 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
220 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  30.85 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
291 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 
205 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.943652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>