More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11992 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 406 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  72.89 
 
 		 391 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.25 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.55 
 
 		 390 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  32.04 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  35.69 
 
 		 470 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 385 aa  123  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 197 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 194 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 195 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 222 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.88 
 
 		 210 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 193 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 212 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 240 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 219 aa  57  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 188 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 243 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 160 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 195 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 204 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  27.13 
 
 		 210 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  48.08 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 201 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  27.27 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 204 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 248 aa  54.3  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 210 aa  54.3  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 205 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 194 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 215 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 211 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 197 aa  53.5  0.000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 201 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.27 
 
 		 207 aa  53.1  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 200 aa  53.1  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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