More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4533 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  435  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  53.18 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  39.83 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  39.83 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  31.79 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  30.38 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  30.38 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  30.38 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  30.38 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  30.38 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  30.38 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 204 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.82 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.55 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 406 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.52 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.94 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>