More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1656 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  33.72 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.14 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 72 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  26.2 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 287 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 406 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0419  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00785696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 280 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>