More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1384 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  70.97 
 
 		 220 aa  278  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 207 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 207 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 197 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  55.03 
 
 		 197 aa  176  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  49.19 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  49.75 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  59.29 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 182 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  50.53 
 
 		 194 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  44.89 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 190 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  52.11 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 199 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  51.57 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 160 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.05 
 
 		 400 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 309 aa  97.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 410 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 363 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 197 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 197 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 197 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 193 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 408 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  30.72 
 
 		 403 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.92 
 
 		 390 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 470 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  24.79 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 287 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.67 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>