More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3151 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  418  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  98.51 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  96.91 
 
 		 200 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  82.18 
 
 		 202 aa  350  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  83.07 
 
 		 190 aa  332  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  82.2 
 
 		 201 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  81.68 
 
 		 201 aa  326  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  81.48 
 
 		 189 aa  323  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  79.49 
 
 		 201 aa  321  5e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  67.2 
 
 		 191 aa  267  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 190 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 193 aa  256  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 194 aa  256  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  61 
 
 		 205 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  62.57 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 194 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 195 aa  175  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 190 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  27.81 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  24.32 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>