More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5264 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 470 aa  910    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.5 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 390 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 394 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 394 aa  143  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 391 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  37.45 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 363 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 408 aa  114  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 396 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 222 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 195 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 195 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 193 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 222 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 204 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 195 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 210 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 194 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 220 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 215 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 189 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 212 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  39.13 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 248 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 190 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 214 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 203 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 225 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 206 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.4 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  40.48 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 202 aa  57  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 206 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 199 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 205 aa  57  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 222 aa  57  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>