More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4104 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 438 aa  874    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 497 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 		 445 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 242 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 190 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 192 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 211 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3730  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  37 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 227 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 206 aa  57  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 184 aa  57  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 207 aa  57  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37 
 
 		 200 aa  57  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 206 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 195 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 216 aa  55.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 197 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 182 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 194 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.24 
 
 		 217 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 187 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 210 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 228 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  48 
 
 		 193 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 208 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 200 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 206 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 205 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 210 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 201 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 226 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  41.67 
 
 		 219 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 199 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 213 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 195 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.94 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 220 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  39.19 
 
 		 209 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 241 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 242 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  54.3  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 201 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 195 aa  53.9  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 210 aa  53.9  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 228 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 215 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 222 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  45.61 
 
 		 215 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 217 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 217 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 217 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>