More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0949 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 190 aa  370  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  67.22 
 
 		 194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  66.11 
 
 		 199 aa  191  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 222 aa  169  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  52.2 
 
 		 197 aa  168  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  67.88 
 
 		 195 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 197 aa  166  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  50.55 
 
 		 195 aa  161  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 207 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 207 aa  160  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  53.3 
 
 		 193 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 225 aa  151  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  53.8 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  50.54 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  48.73 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 206 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  47.52 
 
 		 206 aa  114  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  43.36 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.66 
 
 		 400 aa  98.2  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 410 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 408 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 309 aa  95.1  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 425 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 363 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 197 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  34.21 
 
 		 403 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 424 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  33.97 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 412 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 470 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>