More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0186 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 410 aa  820    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  77.02 
 
 		 408 aa  631  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  63.53 
 
 		 451 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  63.53 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  63.29 
 
 		 451 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  38.03 
 
 		 403 aa  226  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.07 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 425 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  28.53 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  27.79 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 225 aa  99.4  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 190 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 193 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 220 aa  90.5  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 195 aa  89.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 220 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 206 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 193 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 197 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 200 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 199 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.96 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 246 aa  57  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  40.23 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 220 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  55.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 228 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 254 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 213 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 245 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  27.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 182 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 227 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 193 aa  54.7  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 198 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 233 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 291 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 207 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  41.89 
 
 		 217 aa  53.9  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 424 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 195 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  53.5  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 201 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 229 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 202 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  34.83 
 
 		 200 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 221 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 196 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  40 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 194 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 202 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>