More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3985 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 425 aa  837    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  43.25 
 
 		 363 aa  249  7e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 403 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 410 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 451 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 428 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.15 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 412 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  28.61 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 195 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 470 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 206 aa  99.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  28.01 
 
 		 388 aa  99.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 194 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 207 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 195 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 193 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 193 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 199 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 206 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 197 aa  88.2  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 197 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 220 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 190 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 193 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 196 aa  78.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 195 aa  72  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  29.58 
 
 		 215 aa  65.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 201 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 212 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 233 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 223 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 216 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 291 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 237 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  43.21 
 
 		 254 aa  54.3  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 211 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 201 aa  54.3  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 208 aa  53.9  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 211 aa  53.5  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 205 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 188 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 226 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 214 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 217 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 214 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 206 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  27.41 
 
 		 175 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 196 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>