More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0243 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  99 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  97.51 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  97.01 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  90.95 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 199 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  90.95 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 199 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  90.95 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 199 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  90.95 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  90.95 
 
 		 199 aa  377  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  91.46 
 
 		 199 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  84.5 
 
 		 204 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  84 
 
 		 202 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  82.59 
 
 		 202 aa  357  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 211 aa  305  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  71.21 
 
 		 206 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  57.71 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 211 aa  148  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 212 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 205 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  38.58 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 260 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 210 aa  98.2  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 219 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  21.13 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  25.12 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.88 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>