More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0360 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  384  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 220 aa  186  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 190 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 215 aa  106  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 309 aa  105  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 193 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 363 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  37.09 
 
 		 403 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 194 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 197 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 225 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 206 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 182 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 220 aa  91.7  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 408 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 196 aa  91.3  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 410 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 424 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 451 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 428 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 451 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.87 
 
 		 400 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 396 aa  81.6  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  33.86 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 425 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  29.84 
 
 		 390 aa  77.8  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 391 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  32.85 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 412 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 385 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 470 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 388 aa  62  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 393 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 228 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 186 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>