More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_06840 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 
215 aa  411  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  48.17 
 
 
225 aa  168  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
207 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 
207 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  48.5 
 
 
207 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  48.85 
 
 
220 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
215 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
206 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 
206 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  50.6 
 
 
197 aa  136  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  46.74 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  45.62 
 
 
195 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 
197 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  48.41 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  48.25 
 
 
206 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
160 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  45.27 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 
196 aa  107  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 
194 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 
199 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 
309 aa  95.9  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
363 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.34 
 
 
400 aa  87.8  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
425 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  31.36 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
391 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.45 
 
 
390 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 
238 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
412 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
412 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
412 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 
207 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
393 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
470 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
238 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
394 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
394 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
394 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
188 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 
396 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
408 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
406 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
385 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
256 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
317 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.1 
 
 
220 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
205 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 
215 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
217 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  35.24 
 
 
221 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  28.33 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
227 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 
271 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
410 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
225 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 
221 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
257 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
199 aa  54.7  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
198 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
273 aa  54.3  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>