More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2504 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  361  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  68.75 
 
 		 220 aa  188  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  56.58 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  56.08 
 
 		 195 aa  140  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  50.9 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  51.25 
 
 		 196 aa  124  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 224 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 183 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  49.33 
 
 		 213 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  59.05 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  45.34 
 
 		 201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 200 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 227 aa  97.8  7e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  52.11 
 
 		 208 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 204 aa  95.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  54.05 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 230 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  50.83 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  51.16 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  45.76 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  50.75 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>