More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1860 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 204 aa  231  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 209 aa  216  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  47.55 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  44.86 
 
 		 200 aa  131  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  42.21 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  41.53 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  44.78 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 196 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 224 aa  98.2  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 167 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  43.97 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  53.24 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  86.21 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  42.19 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 173 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  48.21 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 227 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0413  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 309 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0976  regulatory protein TetR  28.12 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00018682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  49.12 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.06 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>