More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4087 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  442  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.8 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 266 aa  105  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 223 aa  98.2  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 299 aa  88.2  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 188 aa  85.9  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.78 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  34.81 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  31.55 
 
 		 237 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  37.89 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  53.75 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  53.62 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  34.03 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 193 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  35.53 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  43.02 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  60.34 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  42.98 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.93 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  36.84 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>