More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5356 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  39.11 
 
 		 200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  51.35 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 195 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 227 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  50.86 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 186 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  44.07 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  49.32 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.7 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  40.66 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  40.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  27.69 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 299 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  50.75 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.56 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 259 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  48.15 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>