More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0435 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  64.67 
 
 		 184 aa  232  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  59.78 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  50.97 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  39.78 
 
 		 182 aa  134  9e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  41.57 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  45.57 
 
 		 208 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.05 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 209 aa  96.3  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.78 
 
 		 190 aa  94.4  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  39.61 
 
 		 199 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  41.06 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 186 aa  89.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 207 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 194 aa  88.2  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 189 aa  88.2  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 213 aa  80.9  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  49.41 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  42.31 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.94 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  32.34 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 266 aa  70.9  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  60.34 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  30.34 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  32.39 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
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NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  55.36 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
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NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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