More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4614 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  433  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  39.63 
 
 		 245 aa  137  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  44.86 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  37.36 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 199 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 229 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 188 aa  88.2  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 196 aa  86.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  34.95 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  37.33 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 299 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  37.97 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  35.14 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.6 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 186 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  35.77 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.39 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
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NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
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NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  32.69 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
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NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  44.26 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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