More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5259 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 211 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  56.92 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.12 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 236 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  60.34 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  54.1 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  30.43 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.74 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  31.11 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  28.5 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  49.18 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  31.82 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>