More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6635 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  62.22 
 
 		 195 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  52.25 
 
 		 188 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  51.12 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 184 aa  158  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 184 aa  141  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  41.4 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  50 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 193 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  41.82 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 174 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  47.78 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  42.46 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  38.17 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 192 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  43.65 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  43.26 
 
 		 183 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 194 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 186 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  39.78 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  94.7  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 250 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  39.53 
 
 		 190 aa  94  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 194 aa  92  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 184 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 266 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 185 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 202 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 186 aa  85.1  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  38.02 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 193 aa  84.7  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  40.25 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.6 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  64.29 
 
 		 173 aa  74.7  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  54.65 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  36.54 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>