More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2145 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  100 
 
 		 202 aa  383  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  60.53 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  57.98 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  51.91 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  47.51 
 
 		 174 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  47.03 
 
 		 211 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  44.75 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  60.82 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 209 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.14 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  47.34 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.07 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 196 aa  94.7  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 259 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 188 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 266 aa  91.7  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 184 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.63 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 250 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 189 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 193 aa  88.2  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 207 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 193 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 236 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 208 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  43.03 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.91 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 222 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  36.97 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
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NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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