More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3889 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 309 aa  159  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  47.51 
 
 		 185 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 223 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 188 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 188 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 199 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.79 
 
 		 199 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 188 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 186 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 213 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 193 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 189 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 194 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 192 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 194 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 266 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 192 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 189 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  39.69 
 
 		 222 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 188 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 203 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 196 aa  90.1  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 214 aa  89.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 192 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 206 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 228 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 236 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.36 
 
 		 186 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.63 
 
 		 197 aa  87  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  86.3  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 205 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 223 aa  85.5  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  38.04 
 
 		 174 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.35 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.52 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.17 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.26 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  36.26 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 186 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 208 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  36.32 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 184 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.14 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  33.15 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  35.91 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  39.89 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.91 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>