More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5801 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  376  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  55.06 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  39.05 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  44.75 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 194 aa  97.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 188 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  40.21 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 209 aa  94.4  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.71 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  51.43 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.14 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 192 aa  87.8  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 266 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  39.35 
 
 		 192 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  40.11 
 
 		 195 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.28 
 
 		 190 aa  84.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 207 aa  82  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 202 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.81 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  33.15 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  64.15 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  51.43 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  57.81 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  33.13 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  59.26 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 213 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>