More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3313 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  413  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 199 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  61.75 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 211 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 194 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  55.38 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  59.3 
 
 		 193 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  55.25 
 
 		 192 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  50.28 
 
 		 196 aa  184  6e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  46.99 
 
 		 197 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  47.89 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 189 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 201 aa  138  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.11 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  46.79 
 
 		 229 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  43.55 
 
 		 195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 266 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.64 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 299 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 207 aa  111  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 203 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.64 
 
 		 174 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  40 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 185 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  35.64 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 184 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 158 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 192 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  39.46 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.08 
 
 		 190 aa  94.7  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  51.43 
 
 		 190 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.96 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 217 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 259 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 184 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  37.19 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 184 aa  88.6  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47 
 
 		 183 aa  85.9  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 192 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  34.76 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>