More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3012 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 191 aa  116  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 205 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.16 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  36.2 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 245 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 236 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 206 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.43 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 237 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  38.85 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  51.61 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  31.21 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  54.1 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  28.72 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  58 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
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NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
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NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
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