More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2527 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  67.39 
 
 		 184 aa  241  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  69.84 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  60.45 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  53.98 
 
 		 193 aa  181  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  51.89 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  53.23 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 192 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 158 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 195 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  50.26 
 
 		 196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  43.72 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  46.25 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 192 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  40.88 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  43.65 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 194 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.59 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  38.2 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  42.48 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.7 
 
 		 190 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 201 aa  97.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
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NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36 
 
 		 190 aa  95.5  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.91 
 
 		 176 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 185 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  40.86 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 250 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 223 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  45.92 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  43.93 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.23 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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