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for query gene Franean1_0143 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
266 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 
211 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  36.45 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 
209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 
199 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
223 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 
217 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 
228 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
227 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 
227 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
222 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
184 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 
218 aa  99  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 
195 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
204 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 
216 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 
299 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
213 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 
192 aa  94  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 
208 aa  93.6  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.62 
 
 
189 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
213 aa  92  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 
203 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 
222 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
206 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.02 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
205 aa  89.4  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
194 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
188 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
192 aa  87  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  35.98 
 
 
190 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
214 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
219 aa  82  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
188 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.99 
 
 
223 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
219 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
186 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  34.76 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  34.41 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.63 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 
186 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
195 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
195 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
195 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 
188 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  55.07 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
222 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  41.96 
 
 
207 aa  77  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  32.5 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.73 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
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NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  33.8 
 
 
194 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
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NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 
188 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal 
 
 
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NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.204371 
 
 
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NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.089814 
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 
199 aa  72  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
193 aa  72  0.000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
201 aa  72  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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