More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1574 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  383  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 223 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 223 aa  92.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 217 aa  88.6  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 199 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 213 aa  85.1  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  39.18 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.59 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 216 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  37.59 
 
 		 237 aa  71.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  37.66 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.89 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  35.48 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  29.63 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  35.92 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.3 
 
 		 231 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  30.5 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>