More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6123 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 232 aa  434  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  54.49 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 184 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  49.73 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 188 aa  121  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 194 aa  119  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 186 aa  113  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  42.78 
 
 		 174 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  38.65 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 174 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 193 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 199 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 203 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  33.79 
 
 		 231 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 196 aa  93.2  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  43.21 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  40.64 
 
 		 182 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 193 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 176 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 186 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 192 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.88 
 
 		 190 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 196 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 214 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 188 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.88 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  37.08 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.03 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  37.28 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.55 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  38.42 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  58.21 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  45.61 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.99 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  58.62 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 206 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>