More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0142 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  85.64 
 
 		 186 aa  279  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  59.76 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  57.46 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 194 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 299 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  47.25 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 259 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  40.65 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 197 aa  98.2  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  42.47 
 
 		 202 aa  97.8  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 309 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 176 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 199 aa  94.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 186 aa  92  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 222 aa  91.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 245 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 219 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 193 aa  89  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  40.14 
 
 		 193 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 223 aa  84.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.07 
 
 		 231 aa  84.7  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  48.04 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.36 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  36.09 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  45.45 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  47.19 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  44.52 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  40.97 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  39.58 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  33.91 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  38 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.27 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 250 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  39.33 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 243 aa  71.2  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>