More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0606 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  98.45 
 
 		 194 aa  363  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 186 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  50.27 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 299 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  101  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 209 aa  98.6  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 203 aa  98.2  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.91 
 
 		 174 aa  95.5  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 266 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 188 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 222 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 195 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 174 aa  84.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  46.02 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  45.74 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  41.25 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  46.94 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.54 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  38.99 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.8 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  31.65 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  33.86 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 193 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  48.42 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 245 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  38.42 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  47.25 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>