More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4273 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  100 
 
 		 190 aa  381  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  64.84 
 
 		 193 aa  238  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  69.1 
 
 		 195 aa  224  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 		 192 aa  224  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  66.31 
 
 		 195 aa  222  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  61.11 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 193 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  56.05 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  43.72 
 
 		 207 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 209 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.7 
 
 		 197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  39.43 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  45.62 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  40.21 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  43.87 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  35.5 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 193 aa  94.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  44.3 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  37.34 
 
 		 204 aa  84.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.98 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  42.24 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  40.95 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  40 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  39.82 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  35.46 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  54.69 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>