More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0528 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  381  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 195 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.76 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 199 aa  97.8  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 266 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 201 aa  92  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 203 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 299 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  35.26 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  35.16 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 209 aa  85.1  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  35.84 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.95 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  37.3 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 259 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  36.55 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  32.94 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  38.69 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  46.15 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
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NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  37.06 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  36.7 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 250 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 223 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.42 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 228 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
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NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
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NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  31.95 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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