More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4823 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 219 aa  432  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 174 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 205 aa  92.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  38.36 
 
 		 174 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 188 aa  88.6  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 299 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 196 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  32.79 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  59.65 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  38.1 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  39.07 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  64.15 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 207 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  30.13 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  40.34 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  35.52 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  34.19 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  32.72 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  45.21 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  53.33 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3935  TetR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  33.55 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.23 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>