More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4108 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  100 
 
 		 189 aa  360  7.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  56.33 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  44.51 
 
 		 229 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 236 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  39.41 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 245 aa  95.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 266 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 223 aa  94.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 240 aa  84.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  36.94 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.53 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  37.01 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 259 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.52 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  36.84 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.7 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  34.93 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
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NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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