More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4255 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 223 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  48.58 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  49.76 
 
 		 227 aa  157  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 211 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.11 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  40.72 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 228 aa  98.2  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 188 aa  96.7  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 221 aa  92  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 203 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 188 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 299 aa  85.9  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  36.88 
 
 		 189 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.36 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.92 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  34.63 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  31.75 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 188 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.94 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  39.81 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  33.7 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
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NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  36.5 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
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NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.98 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 184 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
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NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
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NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  28.49 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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