More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0403 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  46.49 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  39.67 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  41.08 
 
 		 216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  45.09 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  43.54 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 245 aa  101  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.88 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 220 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  38.25 
 
 		 188 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 188 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 266 aa  92  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 217 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 299 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 182 aa  85.1  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  36.62 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.66 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.94 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  33.17 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  35 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  45.36 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  34.24 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  34.22 
 
 		 223 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.6 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
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