More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5011 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 201 aa  181  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  51.12 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  51.4 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  42.29 
 
 		 174 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  45.81 
 
 		 193 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.33 
 
 		 209 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  35.2 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.76 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  41.03 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  36.17 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 192 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 186 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 207 aa  98.6  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  37.95 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  40.33 
 
 		 173 aa  95.1  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 206 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  36.11 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 186 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  41.36 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 266 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 195 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  38.42 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 202 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 194 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  38.07 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 188 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 207 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  35.46 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  35.29 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  38.86 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>