More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5174 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  59.78 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  58.79 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 185 aa  118  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 196 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 184 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 259 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2082  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 309 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.707257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 299 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.22 
 
 		 174 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 192 aa  97.8  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 184 aa  95.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 194 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 199 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.44 
 
 		 182 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 250 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 184 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 199 aa  91.3  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  36.46 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  33.52 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 245 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 211 aa  87.8  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 200 aa  87  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.58 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 176 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 214 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  30.6 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  38.5 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 216 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  33.51 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  35.42 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  36.88 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.69 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
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NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
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NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.66 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
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NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
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NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
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NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
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