More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5119 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 186 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  47.12 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.09 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  48.35 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 193 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 194 aa  144  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  43.41 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  43.58 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 193 aa  140  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 196 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 196 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.76 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 207 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 198 aa  117  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 198 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 201 aa  114  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 193 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 188 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.22 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  40.22 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  40.34 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 193 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 184 aa  97.4  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 207 aa  94.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 202 aa  89.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 259 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 186 aa  88.6  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 202 aa  87.8  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  38.95 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 266 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 174 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 190 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 193 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 299 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 201 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  43.12 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  40.87 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  34.59 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2097  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530578  normal  0.137365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>