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for query gene RS05498 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  54.14 
 
 
199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  51.83 
 
 
194 aa  193  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  51.34 
 
 
211 aa  190  9e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  49.19 
 
 
194 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 
193 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 
209 aa  169  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
193 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
196 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  42.78 
 
 
231 aa  143  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
192 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
186 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 
193 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  38.76 
 
 
189 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 
188 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 
207 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 
199 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 
192 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  36.7 
 
 
190 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
184 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  40.76 
 
 
195 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  36.61 
 
 
174 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 
229 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 
193 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
245 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
174 aa  98.6  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
196 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  46.9 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
195 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 
189 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
201 aa  94  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  37.14 
 
 
202 aa  91.3  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
184 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  38.71 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  45.13 
 
 
188 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
188 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
185 aa  88.2  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.64 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
181 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
188 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 
299 aa  87  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2205  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.78 
 
 
182 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
176 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
217 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
216 aa  82  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 
184 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  34.05 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1574  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  35 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  36.54 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 
195 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
227 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  32.09 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  36.76 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 
259 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  41.23 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
266 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
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NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
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NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
213 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  49.3 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal 
 
 
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NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
173 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
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