More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0946 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  437  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  45.77 
 
 		 204 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0877  transcriptional regulator, TetR family  45.18 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 222 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  39.59 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  41.11 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4137  TetR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.857074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 219 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5834  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 216 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  39.3 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 266 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 195 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 299 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  41.45 
 
 		 189 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 222 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  36.82 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 206 aa  85.9  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  40.31 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0420  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.15036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 192 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  32.7 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  37.89 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  40.94 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1213  regulatory protein TetR  34.09 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.02381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  32.78 
 
 		 182 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 174 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  35.06 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  33.53 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4504  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  58.93 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  32.67 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>