More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2647 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 217 aa  424  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  42.39 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.37 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 266 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  104  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 209 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5586  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 191 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.75 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 299 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.89 
 
 		 174 aa  86.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.16 
 
 		 182 aa  85.9  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 199 aa  85.5  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 174 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  34.86 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 210 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1574  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2443  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0220439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  34.43 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  36.02 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  55.13 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  37.16 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21000  transcriptional regulator, tetR family  35.39 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  0.198219 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  35.68 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
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NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  43.53 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
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