More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1469 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  100 
 
 		 209 aa  398  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  57.98 
 
 		 202 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 174 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  44.13 
 
 		 174 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.39 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  51.12 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  43.09 
 
 		 195 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  43.24 
 
 		 211 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2829  regulatory protein TetR  46.7 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  37.78 
 
 		 231 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  38.59 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 184 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 194 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.9 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  41.28 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 186 aa  98.2  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 250 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 259 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 184 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 266 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 205 aa  89.4  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 299 aa  89  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 184 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 217 aa  84.7  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 213 aa  84.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  44.95 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  34.24 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2944  regulatory protein, TetR  39.9 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0291175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5106  putative transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0586714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0763  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711774 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0142  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3165  TetR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.871472  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  36.63 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1559  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal  0.011068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4273  regulatory protein TetR  36.09 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.532743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>